MAILCHIMP

16S Identification

Réservez votre consultation gratuite

Désormais, si vous aimez ce que vous lisez ou si vous avez des questions supplémentaires, vous pouvez réserver une réunion en ligne gratuite pour discuter de votre projet avec nos consultants. Parlez-nous de votre projet et nous trouverons le consultant qui vous convient.

L'analyse génomique de plusieurs organismes obtenus à partir d'un seul échantillon, communément appelée « métagénomique », permet de mieux comprendre la composition génétique des communautés microbiennes, y compris les espèces qui ne peuvent pas être cultivées et isolées en laboratoire.

16S Identification

Faster? Impossible!

Create an account on our ordering platform and submit orders right from your lab chair.

Réservez votre consultation gratuite

Désormais, si vous aimez ce que vous lisez ou si vous avez des questions supplémentaires, vous pouvez réserver une réunion en ligne gratuite pour discuter de votre projet avec nos consultants. Parlez-nous de votre projet et nous trouverons le consultant qui vous convient.

Technologie

Technologie de séquençage de troisième génération, également connu sous le nom de séquençage des nanopores, est une approche révolutionnaire pour séquencer entièrement des molécules génomiques. Alors que d'autres technologies de séquençage ne permettent d'obtenir que des centaines de paires de bases, le séquençage par nanopores peut en couvrir des milliers en une seule lecture. Cela crée une opportunité pour séquencer un produit de PCR complet obtenu à partir d'une ou de plusieurs espèces d'un échantillon, tel que le gène de l'ARNr 16s qui a été une norme pour la classification taxonomique.

Demandes

Les applications de ce service sont multiples, telles que : la confirmation d'échantillons préalablement séquencés, découverte de nouvelles espèces, classification d'un consortium, études sur des échantillons environnementaux, études de l'évolution de la composition des microbiomes au fil du temps et plus encore.

Avantages

Pas besoin de purifier les cultures, sauf si vous souhaitez l'assemblage de novo de l'ARNr 16S complet.

Il n'est pas nécessaire d'examiner des régions variables spécifiques, vous pouvez les séquencer toutes en même temps.

Tableau d'abondance des espèces fourni.

Précision de lecture brute > Q15 avec profondeur de séquençage élevée

Réservez votre consultation gratuite

Désormais, si vous aimez ce que vous lisez ou si vous avez des questions supplémentaires, vous pouvez réserver une réunion en ligne gratuite pour discuter de votre projet avec nos consultants. Parlez-nous de votre projet et nous trouverons le consultant qui vous convient.

Flux de travail

Nous amplifions l'intégralité du gène de l'ARNr 16S à l'aide des apprêts universels 27F et 1492R générer un produit d'environ 1 500 pb à partir de l'ADNg extrait.

Plus tard, cela est séquencé avec le séquençage des nanopores, produisant des données de séquençage complètes. Cet amplicon contenant les régions variables 1 à 9 permet l'analyse de ce gène parmi les organismes procaryotes présents dans vos échantillons, en accélérant l'identification et en la rendant rentable.

La classification taxonomique est réalisée avec Kraken2 et la base de données de référence du NCBI.

Kit de bibliothèque

Depuis Macrogen Europe, nous recommandons d'envoyer au moins 10 μl pour des résultats optimaux.

Sequencers

Book your free consultation

Now, if you like what you read or you have any extra questions, you can book a free online meeting to discuss your project with our consultants. Tell us about your project and we will get the correct consultant for you

Ce graphique de LIMA EUROPE NV

PLUS DE BIOINFORMATIQUE