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Identifiez les espèces bactériennes à l'aide des services de séquençage des ARNr 16S, 18S et ITS de Macrogen Europe. Ce service complet comprend l'extraction d'ADN, la PCR, le séquençage et l'assemblage de bactéries et de champignons (champignons filamenteux, levures). Macrogen Europe propose également des analyses phylogénétiques pour améliorer vos recherches.
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16S fait référence à une section de l'ARN ribosomique bactérien qui n'est présente que parmi les espèces bactériennes et qui est hautement conservée. Cette conservation nous permet d'identifier différentes espèces, car entre les régions hautement conservées de l'ADN se trouvent des séquences uniques à chaque espèce.
C'est également le cas pour les champignons des régions 18S, 26S et ITS, qui sont utilisés pour identifier les espèces individuelles de ce règne, notamment les moisissures, les levures et les champignons. Une fois que l'ARN ribosomique des champignons ou des bactéries a été séquencé, il est ensuite soumis à une recherche BLAST pour le comparer à l'ADN d'espèces connues. Lorsqu'il y a correspondance, cela signifie que l'espèce en question a été identifiée avec succès.
Pour les bactéries, les résultats de séquençage sont garantis pour 1 300 paires de bases d'ARNr 16S.
Pour les champignons (champignons filamenteux, levures), les résultats du séquençage sont garantis pour 600 paires de bases d'ITS, ARNr et 1100 paires de bases d'ARNr ITS + 26S (région D1/D2).
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Macrogen Europe propose le séquençage des 4 sites d'identification (régions 16s, 18s, 26s et ITS) et le flux de travail pour cela est le suivant :
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