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Services d'identification

Identifiez les espèces bactériennes à l'aide des services de séquençage des ARNr 16S, 18S et ITS de Macrogen Europe. Ce service complet comprend l'extraction d'ADN, la PCR, le séquençage et l'assemblage de bactéries et de champignons (champignons filamenteux, levures). Macrogen Europe propose également des analyses phylogénétiques pour améliorer vos recherches.

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16S fait référence à une section de l'ARN ribosomique bactérien qui n'est présente que parmi les espèces bactériennes et qui est hautement conservée. Cette conservation nous permet d'identifier différentes espèces, car entre les régions hautement conservées de l'ADN se trouvent des séquences uniques à chaque espèce.

C'est également le cas pour les champignons des régions 18S, 26S et ITS, qui sont utilisés pour identifier les espèces individuelles de ce règne, notamment les moisissures, les levures et les champignons. Une fois que l'ARN ribosomique des champignons ou des bactéries a été séquencé, il est ensuite soumis à une recherche BLAST pour le comparer à l'ADN d'espèces connues. Lorsqu'il y a correspondance, cela signifie que l'espèce en question a été identifiée avec succès.

Nous garantissons les paramètres suivants pour vos échantillons

Pour les bactéries, les résultats de séquençage sont garantis pour 1 300 paires de bases d'ARNr 16S.
Pour les champignons (champignons filamenteux, levures),
les résultats du séquençage sont garantis pour 600 paires de bases d'ITS, ARNr et 1100 paires de bases d'ARNr ITS + 26S (région D1/D2).

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Formulaire de synthèse peptidique

1. En fonction de votre demande, téléchargez le Formulaire de synthèse peptidique personnalisé ou Formulaire de synthèse peptidique de modification.
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3. Téléchargez le formulaire de synthèse peptidique rempli et soumettez-le
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Formulaire de synthèse d'ARN

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3. Téléchargez le formulaire de synthèse peptidique rempli et soumettez-le
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Formulaire de synthèse génique

1. Téléchargez le Formulaire de synthèse génique et remplissez-le avec les informations nécessaires. Vous pouvez ajouter plus d'un gène.
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3. Téléchargez le formulaire de synthèse génétique rempli et soumettez-le
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flux de travail

Macrogen Europe propose le séquençage des 4 sites d'identification (régions 16s, 18s, 26s et ITS) et le flux de travail pour cela est le suivant :

  1. Les échantillons sont envoyés sous forme de colonies individuelles sur des plaques de gélose scellées au parafilm ou sous forme de stock de glycérol.
  2. Si les échantillons sont envoyés sous forme de stocks de glycérol ou de colonies individuelles, une extraction d'ADN aura lieu ; Les échantillons peuvent également être envoyés sous forme d'ADNg qui a déjà été extrait de la colonie et, dans ce cas, une extraction d'ADN ne serait pas nécessaire une fois qu'il atteint notre laboratoire.
  3. À partir de là, la région d'intérêt serait amplifiée par PCR, puis purifiée pour fournir des résultats de la meilleure qualité.
  4. Ensuite, un séquençage direct et inverse de Sanger aurait lieu pour séquencer la région de l'ADN qui est unique à chaque espèce de bactérie/champignon.
  5. Cette séquence serait ensuite soumise à une recherche BLAST, l'espèce de micro-organisme étant identifiée au cours du processus.

Sequencers

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