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Découvrez les facteurs épigénétiques qui influencent l'expression et la fonction des gènes. Nos services épigénomiques polyvalents, tels que le séquençage du génome entier au bisulfite, le séquençage ciblé par capture de méthylation et le séquençage ChIP, peuvent vous aider à analyser la méthylation de l'ADN et à étudier les interactions entre l'ADN et les protéines histones.
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Le séquençage de l'épigénome peut vous aider à élucider le rôle complexe entre les facteurs environnementaux externes et l'expression des gènes. La méthylation de l'ADN et les interactions ADN-histones font partie des mécanismes de contrôle épigénétique les plus couramment étudiés pour la transcription des gènes et ces processus peuvent être analysés efficacement grâce au séquençage de nouvelle génération (NGS).
Comme pour le séquençage du génome et de l'ARN, le séquençage de l'épigénome peut être effectué pour un génome entier ou de manière ciblée. Le séquençage au bisulfite du génome entier (WGBS) est une méthode permettant de mesurer le degré de méthylation de l'ADN dans l'ensemble du génome. Il agit en traitant l'ADN avec du bisulfite de sodium, qui convertit la cytosine non méthylée en uracile, et en analysant la séquence.
Le séquençage ciblé, ou capture de méthyle, est une méthode qui se concentre sur les sections les plus pertinentes du génome du point de vue de la méthylation. Ces sections comprennent des îlots CpG, souvent présents dans les régions promotrices, et d'autres régions méthylées de manière différentielle (DMR) connues. L'ADN de ces régions est capturé de manière sélective, traité au bisulfite et séquencé.
Le séquençage par immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) analyse spécifiquement les fragments d'ADN en fonction de leur interaction avec les protéines. Il agit en fragmentant l'ADN tout en préservant les liaisons ADN-protéine intactes, puis en isolant les fragments d'ADN pertinents en capturant une protéine d'intérêt. Le séquençage et la cartographie des fragments capturés permettent de mieux comprendre le rôle de cette protéine dans le génome.
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Vous pouvez consulter la liste de tous les kits de bibliothèque disponibles et les critères d'échantillonnage de Macrogen Europe. Des échantillons RTR ? Vous pouvez également trouver les critères de la bibliothèque au cas où votre échantillon serait prêt pour le séquençage.
Avez-vous besoin de connaître la matière de méthylation chez l'homme ou la mousse ? Notre partenariat avec Agilent nous permet de fournir des kits de bibliothèque pour les deux. Grâce à Illumina et à d'autres fournisseurs principaux, notre variété de kits de bibliothèque couvre tous les besoins que vous pourriez avoir en matière de projet. Jetez un œil à nos kits les plus vendus pour le séquençage de l'épigénome
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Il est essentiel de connaître l'objectif de votre recherche pour établir la configuration de séquençage et l'analyse statistique correctes. Dites-nous quel est l'objectif de votre recherche et nous vous guiderons pour obtenir les bons services bioinformatiques.
Pour la plupart des chercheurs, l'obtention de données RAW est suffisante pour leurs recherches. Cependant, Macrogen Europe est également prête à fournir des analyses bioinformatiques pour votre projet.
Nous nous efforçons de vous fournir quelques exemples du type de graphiques et d'analyses pour le séquençage de l'épigénome.
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