Désormais, si vous aimez ce que vous lisez ou si vous avez des questions supplémentaires, vous pouvez réserver une réunion en ligne gratuite pour discuter de votre projet avec nos consultants. Parlez-nous de votre projet et nous trouverons le consultant qui vous convient.
Découvrez en détail les communautés microbiennes présentes dans vos échantillons, même celles qui sont difficiles à cultiver en laboratoire, grâce au séquençage métagénomique. Nos services de séquençage pour le séquençage d'amplicons et de fusils de chasse peuvent vous aider à identifier les microbes et à trouver des informations fonctionnelles rapidement et facilement.
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Le séquençage Shotgun et Amplicon nous permet d'étudier le métagénome. Jetons un coup d'œil à leurs différences :
Le séquençage métagénomique Shotgun est une méthode complète d'examen de tous les gènes de tous les microorganismes présents dans un échantillon, similaire au séquençage du génome entier. La méthode vous permet d'évaluer la diversité microbienne et de détecter l'abondance des espèces dans différentes conditions. Lors du séquençage au fusil de chasse, l'ADN total d'un échantillon est isolé et découpé au hasard en fragments plus petits avant le séquençage.
Le séquençage métagénomique par amplicon est similaire au séquençage ciblé et permet d'identifier efficacement la diversité des micro-organismes dans un échantillon grâce à l'analyse des unités taxonomiques opérationnelles (OTU). Il fonctionne par amplification par PCR de gènes conservés tels que 16S, 18S, ITS et CO1 et par séquençage des amplicons résultants.
Découvrez nos services d'ARNr 16S, 18S et ITS basés sur le séquençage de Sanger ici.
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Vous pouvez consulter la liste de tous les kits de bibliothèque disponibles et les critères d'échantillonnage de Macrogen Europe. Des échantillons RTR ? Vous pouvez également trouver les critères de la bibliothèque au cas où votre échantillon serait prêt pour le séquençage.
Macrogen Europe dispose des kits de bibliothèque dont vous avez besoin pour identifier des amplicons spécifiques (16S, 18S, ITS ou Arc). Mais nous pouvons également concevoir le produit personnalisé dont votre projet a besoin. Notre partenariat avec Illumina, PacBio et Oxford Nanopore couvre tous les projets auxquels vous participez, qu'il s'agisse d'un fusil de chasse ou d'un amplicon. Jetez un œil aux kits de bibliothèque les plus vendus pour le séquençage du métagénome.
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Vous pouvez consulter la liste de tous les kits de bibliothèque disponibles et les critères d'échantillonnage de Macrogen Europe. Des échantillons RTR ? Vous pouvez également trouver les critères de la bibliothèque au cas où votre échantillon serait prêt pour le séquençage.
Now, if you like what you read or you have any extra questions, you can book a free online meeting to discuss your project with our consultants. Tell us about your project and we will get the correct consultant for you
Désormais, si vous aimez ce que vous lisez ou si vous avez des questions supplémentaires, vous pouvez réserver une réunion en ligne gratuite pour discuter de votre projet avec nos consultants. Parlez-nous de votre projet et nous trouverons le consultant qui vous convient.
Vous pouvez consulter la liste de tous les kits de bibliothèque disponibles et les critères d'échantillonnage de Macrogen Europe. Des échantillons RTR ? Vous pouvez également trouver les critères de la bibliothèque au cas où votre échantillon serait prêt pour le séquençage.
Il est essentiel de connaître l'objectif de votre recherche pour établir la configuration de séquençage et l'analyse statistique correctes. Dites-nous quel est l'objectif de votre recherche et nous vous guiderons pour obtenir les bons services bioinformatiques.
Pour la plupart des chercheurs, l'obtention de données RAW est suffisante pour leurs recherches. Cependant, Macrogen Europe est prête à fournir des analyses bioinformatiques pour votre projet.
Consultez certains des extraits des rapports d'analyse OTU pour le séquençage du métagénome.
Le graphique montre la composition taxonomique de chaque échantillon, du phylum au niveau de l'espèce (axe X : nom de l'échantillon ; axe Y : proportions OTU). Avec la mousse sur le graphique, vous verrez quels taxons contribuent au pourcentage.
Il montre la diversité alpha de chaque échantillon dans un tableau OTU, en utilisant diverses mesures de diversité alpha (couverture de Chao1, Shannon, Simpsons, Good).
Seuls les comptes d'OTU bruts par échantillon, les comptes étant colorés en fonction de la contribution de chaque OTU au nombre total d'OTU présents dans cet échantillon. Vous verrez également le nombre de fois où chaque OTU a été trouvée dans cet échantillon. Dans le rapport d'origine, en plaçant la souris sur un décompte individuel, vous trouverez plus d'informations supplémentaires, telles que des attributions taxonomiques et des liens vers les informations de recherche Google.
Il est essentiel de connaître l'objectif de votre recherche pour établir la configuration de séquençage et l'analyse statistique correctes. Dites-nous quel est l'objectif de votre recherche et nous vous guiderons pour obtenir les bons services bioinformatiques.