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Transcriptome spatial

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Obtenez des informations plus détaillées sur la structure et l'organisation des tissus en ajoutant des informations spatiales à vos données génomiques. En montrant quels profils d'expression se produisent et où, la transcriptomique spatiale vous permet de créer des cartes détaillées des tissus sains et malades sur la base des données de séquences d'ARNm.

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De nombreuses études sur le transcriptome tirent grandement parti de l'information spatiale. Le service de transcriptomique spatiale de Macrogen Europe utilise la technologie 10x Genomics Visium pour vous aider à créer des cartes précises d'expression d'ARNm de vos lames de tissus.

Notre service fonctionne comme suit : vous nous envoyez vos blocs de tissu fixé au formol et enrobé de paraffine (FFPE). Nous utiliserons la technologie Visium 10x pour coder l'ARNm présent sur la lame d'une manière spécifique à l'emplacement. Nous préparons ensuite les bibliothèques et séquençons les échantillons, avec les codes-barres garantissant que chaque séquence peut être retracée jusqu'à un emplacement sur la lame.

Cette technologie vous permet d'obtenir une vision sans précédent de l'organisation des tissus complexes en combinant l'histologie avec les données de séquençage spatial de l'ARNm. Il peut également fournir des données uniques sur la progression de la maladie, par exemple sur la façon dont les nouvelles mutations apparaissent et s'organisent dans les tissus cancéreux.

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Vous recherchez d'autres kits de bibliothèque ? Prêt à prélever des échantillons ?

Vous pouvez consulter la liste de tous les kits de bibliothèque disponibles et les critères d'échantillonnage de Macrogen Europe. Des échantillons RTR ? Vous pouvez également trouver les critères de la bibliothèque au cas où votre échantillon serait prêt pour le séquençage.

Kits de bibliothèque

Notre partenariat avec 10X Genomics et Singleron est là pour vous. Contactez-nous et parlez-nous de votre projet, et nous vous guiderons pour obtenir la configuration de séquençage la mieux adaptée aux besoins de votre projet.

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Sequencers

  • Illumina
  • NovaSeq X
  • Nouveau Seq 6000
  • Suite suivante
  • PAC Bio
  • Révision
  • PacBio, suite II e
  • Nanopore d'Oxford
  • Prométhion

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Oui, nous avons la bioinformatique en interne

Il est essentiel de connaître l'objectif de votre recherche pour établir la configuration de séquençage et l'analyse statistique correctes. Dites-nous quel est l'objectif de votre recherche et nous vous guiderons pour obtenir les bons services bioinformatiques.

Des données brutes aux services personnalisés

Pour la plupart des chercheurs, l'obtention de données RAW est suffisante pour leurs recherches. Cependant, Macrogen Europe est également prête à fournir des analyses bioinformatiques pour votre projet.

Nous nous efforçons de vous fournir quelques exemples du type de graphiques et d'analyses pour le séquençage spatial du transcriptome.

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