Séquençage ciblé

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Le séquençage par panel ciblé associe un séquençage rentable à une couverture élevée des gènes qui vous intéressent. En savoir plus sur nos services de panel ciblés pour les échantillons de tissus, le FFPE, le sang, les cultures cellulaires et de nombreux autres types d'échantillons.

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Le séquençage ciblé fonctionne en préparant des bibliothèques de séquençage qui ne couvrent que des régions sélectionnées d'un génome. Cette approche est bien adaptée à l'étude d'un panel défini de gènes et peut apporter des améliorations de plusieurs ordres de grandeur en termes d'efficacité par rapport au séquençage du génome entier et au séquençage de l'exome entier.

Cette efficacité accrue permet d'économiser du temps et de la puissance de calcul, mais permet également d'analyser les régions sélectionnées avec une très grande profondeur de couverture. L'augmentation de la profondeur de séquençage contribue à accroître la fiabilité et à détecter des mutations rares présentant une faible fréquence des variants alléliques (VAF).

Demandes

L'oncologie est un domaine clé qui bénéficie grandement d'une approche de séquençage ciblée. Les panels de cancérologie qui ciblent les points chauds de mutation, les oncogènes et les gènes suppresseurs de tumeurs sont très bénéfiques à la fois pour la recherche et les applications cliniques.

Pourquoi Macrogen Europe ?

Chez Macrogen Europe, nous proposons diverses méthodes d'enrichissement de cibles, telles que l'enrichissement de cibles basé sur l'hybridation et la génération d'amplicons par PCR. Nous pouvons également vous aider à créer un panel personnalisé avec les gènes qui vous intéressent. L'ADN provenant de tissus frais, de tissus fixés au formol ou enrobés de paraffine (FFPE), de sang, de cultures cellulaires, d'aspirats à l'aiguille fine (FNA) et de nombreux autres échantillons peut être utilisé.

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Vous recherchez d'autres kits de bibliothèque ? Prêt à prélever des échantillons ?

Vous pouvez consulter la liste de tous les kits de bibliothèque disponibles et les critères d'échantillonnage de Macrogen Europe. Des échantillons RTR ? Vous pouvez également trouver les critères de la bibliothèque au cas où votre échantillon serait prêt pour le séquençage.

Kits de bibliothèque

Nous pouvons fournir des kits basés sur l'hybridation grâce à nos principaux fournisseurs Agilent et Twist. Nous pouvons également fournir des kits à base d'amplicons fournis par Illumina. Jetez un œil aux kits de bibliothèque les plus vendus pour le séquençage de l'exome entier

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Sequencers

  • Illumina
  • NovaSeq X
  • Nouveau Seq 6000
  • Suite suivante
  • MiSeq

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Des données brutes aux services personnalisés

Pour la plupart des chercheurs, l'obtention de données RAW est suffisante pour leurs recherches. Cependant, Macrogen Europe est également prête à fournir des analyses bioinformatiques pour votre projet.

Nous nous efforçons de vous fournir quelques exemples du type de graphiques et d'analyses pour le séquençage ciblé.