Le séquençage ciblé fonctionne en préparant des bibliothèques de séquençage qui ne couvrent que des régions sélectionnées d'un génome. Cette approche est bien adaptée à l'étude d'un panel défini de gènes et peut apporter des améliorations de plusieurs ordres de grandeur en termes d'efficacité par rapport au séquençage du génome entier et au séquençage de l'exome entier.

Cette efficacité accrue permet d'économiser du temps et de la puissance de calcul, mais permet également d'analyser les régions sélectionnées avec une très grande profondeur de couverture. L'augmentation de la profondeur de séquençage contribue à accroître la fiabilité et à détecter des mutations rares présentant une faible fréquence des variants alléliques (VAF).

Demandes

L'oncologie est un domaine clé qui bénéficie grandement d'une approche de séquençage ciblée. Les panels de cancérologie qui ciblent les points chauds de mutation, les oncogènes et les gènes suppresseurs de tumeurs sont très bénéfiques à la fois pour la recherche et les applications cliniques.

Pourquoi Macrogen Europe ?

Chez Macrogen Europe, nous proposons diverses méthodes d'enrichissement de cibles, telles que l'enrichissement de cibles basé sur l'hybridation et la génération d'amplicons par PCR. Nous pouvons également vous aider à créer un panel personnalisé avec les gènes qui vous intéressent. L'ADN provenant de tissus frais, de tissus fixés au formol ou enrobés de paraffine (FFPE), de sang, de cultures cellulaires, d'aspirats à l'aiguille fine (FNA) et de nombreux autres échantillons peut être utilisé.