Bien que les deux méthodologies se penchent sur l'analyse de l'ADN au niveau d'une base unique, leurs approches diffèrent considérablement.
Le séquençage de Sanger repose sur la technique de coloration pionnière introduite par Frédéric Sanger. Cette méthode génère des fragments de la séquence cible, chacun étant initié à partir d'une amorce mais terminé à des longueurs variables. Chaque fragment se termine par un marqueur fluorescent, distingué par différentes couleurs correspondant aux nucléotides A, C, G et T. Ces fragments sont discernés après séparation par électrophorèse capillaire, également connu sous le nom de séquençage par électrophorèse capillaire (CES).
D'autre part, le NGS englobe un large éventail de techniques de séquençage de bibliothèques d'ADN. Ces bibliothèques comprennent de vastes collections de courts fragments d'ADN, provenant d'ADN ou d'ARN génomique fragmenté, d'amplicons ou même de fragments de génomes mixtes provenant de diverses espèces (métagénomes). Dans cette méthodologie à haut débit, toutes les séquences d'une bibliothèque sont séquencées collectivement, une analyse bioinformatique ultérieure étant utilisée pour reconstruire la ou les séquences d'origine de manière exhaustive.
Essentiellement, le séquençage de Sanger offre une approche rapide, fiable et rentable pour l'examen d'un nombre limité de courtes régions génomiques. En revanche, le séquençage de nouvelle génération (NGS) excelle dans l'exploration efficace de régions génomiques étendues, telles que des génomes entiers ou des exomes, en tirant parti de technologies de séquençage massivement parallèles.
Le séquençage de Sanger fait preuve d'une précision inégalée dans l'analyse de séquences allant de centaines à des milliers de bases. Sa précision le rend inestimable pour identifier les polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) à des loci spécifiques, ainsi que pour identification des espèces grâce à l'analyse de molécules telles que l'ARNr 16S.
De plus, le flux de travail rationalisé du séquençage de Sanger le rend adapté aux applications où des résultats rapides sont impératifs. Par exemple, chez Macrogen Europe, nous proposons le séquençage de Sanger avec des délais d'exécution aussi rapides dans les 24 heures.
Le NGS apparaît comme la technologie préférée pour étudier de vastes régions du génome, transcriptome, ou épigénome. Sa capacité de séquençage massivement parallèle permet l'exploration efficace de diverses entités génomiques, allant de ciblé des panels de gènes pour des génomes entiers ou des exomes.
NGS brille également dans métagénomique, facilitant l'étude approfondie de toutes les espèces présentes dans un échantillon mixte. Cela est particulièrement bénéfique pour l'analyse du microbiome, où le NGS peut identifier des espèces à l'aide du séquençage par amplicon 16S ou explorer des génomes entiers grâce à un méta-séquençage.
Chez Macrogen Europe, nous proposons une gamme de Séquençage de Sanger et Services du NGS, y compris le séquençage massivement parallèle. Si vous n'êtes pas certain de la technique la mieux adaptée à vos besoins, communiquez avec nous dès maintenant pour une consultation gratuite et découvrez la solution optimale adaptée à vos besoins.